国内发展合作部已经在多个地方建立政策研究实践平台，包括河北河间、浙江绍兴、新疆和田、山西大同等多个地区；在政策咨询方面，国内发展合作部已为雄安新区、西藏、山西晋城、广东中山、广州、宁波象山等多个地方提供政策咨询服务，助力地方实现高质量发展；在企业咨询方面，国内发展合作部已为腾讯等企业提供战略咨询服务，举办多场相关产业研讨会，包括“新结构汽车产业发展研讨会”、“促进数字经济与实体经济融合发展研讨会”等高端产业发展研讨会，为强化企业的核心竞争力提供有力的思想武器和方法论工具。
1. 国家发展和改革委员会：“十四五”规划实施中期评估
2023年3月，为支持做好“十四五”规划实施中期评估工作，北京大学新结构经济研究院受国家发展改革委规划司委托，为十四五时期推动高质量发展进展情况及下一步对策提供建议。系统总结贯彻新发展理念、推动高质量发展有关进展情况，深入分析存在的突出问题及其原因，研究并提出下一步需要着力的重点方向及对策建议。
2. 教育部社科重大项目：规模优势与大国经济发展
教育部哲学社会科学研究重大项目《规模优势与大国经济发展》基于中国作为发展中大国的特殊性，首先梳理当前面临内外部环境变化。其次，归纳总结中国具备全球性的政治经济影响力；土地广袤，地区间发展不平衡；人口众多，具有较大的市场规模；集中力量办大事的举国体制；自主创新与国际技术引进齐头并进等五个方面的发展特征，分析中国在发展过程中面临的现实问题。再次，针对不同特征所反映出的现实问题，分析其背后的理论机理。最后，基于中国所处阶段的特殊性，给予相应的政策建议，努力构建中国经济学自主知识体系。
3. 国家林业与草原局：支持林业发展的财政金融体系设计
2023年6月-2024年1月，北京大学新结构经济学研究院受国家林草局委托开展研究课题，并发布了《支持林业发展的财政金融体系设计》成果报告。课题组前往福建省南平市、三明市以及浙江省衢州市、丽水市等集体林区进行调研，在新结构经济学的分析方法与新结构金融学的理论框架内，剖析了林业产业的特殊性，以及与其相适宜的金融需求特性与结构。从财政金融工具支持林业发展的现实意义、政策体系及资金体系特征、融资工具及典型模式、瓶颈约束等方面着手，对当前阶段支持林业发展财政金融体系的相关问题进行分析，并提出了政策设计的策略建议。
4. 国家乡村振兴局：金融支持乡村振兴研究、脱贫人口小额信贷研究
2021年-2022年，受国家乡村振兴局委托，新结构院连续两年承担金融支持乡村振兴年度工作跟踪监测项目。基于新结构经济学的理论视角，2021年课题组立足新阶段农村金融的新需求，研究提出创新产品、完善服务做好金融服务乡村振兴工作的政策建议；2022年课题组聚焦乡村建设资金需求，探索金融更好支持乡村建设的可行路径。此外，课题组以电话调研和入户调研相结合的形式，识别脱贫人口小额信贷政策执行过程中的堵点，为打通堵点提供可行的方案。该项目历经两期，完成了《金融支持乡村振兴研究报告》（2021）、《金融支持乡村建设研究报告》（2022）《脱贫人口小额信贷研究报告》（2021、2022）、《脱贫人口小额信贷电话调研报告》（2021、2022）等6份研究报告及对应内参，为金融支持乡村建设的推进提供决策参考。
5. 民政部：银发经济研究
世界经济发展历程表明，一个国家现代化的进程往往和老龄化相伴相生。科学辩证地看待人口老龄化问题，深入剖析中国式老龄化的特征及其经济影响机制，对推进经济高质量发展与银发经济高质量发展协同共进具有重要的理论与实践意义。
6. 国务院国资委：国有经济论
国有经济论是国务院国资委委托的重大课题。国有经济是中国特色社会主义的重要物质基础和政治基础，是经济稳定与宏观调控的“压舱石”，在服务国家战略、支撑经济发展、保障民生福祉等方面发挥着不可替代的作用。
1. 西藏自治区：政府、市场与西藏发展理念创新研究
2016年4月-2017年9月，北京大学新结构经济学研究中心与西藏自治区政府合作开展研究课题，并发布《西藏自治区特色产业发展调查研究报告》。课题组五次进藏深入调研，组织了一次大规模问卷调研，从新结构经济学的视角剖析了西藏自治区内特色产业发展的现状和面临的问题挑战，提出行之有效的转型升级对策建议。
2. 吉林省：经济结构转型升级研究
2016年10月-2017年8月，北京大学新结构经济学研究中心与吉林省政府合作开展《吉林省经济结构转型升级研究》研究课题，课题组基于吉林省潜在比较优势产业，重点对吉林省建设大农业、大健康、大装备制造、轻纺产业、新能源新材料新一代信息技术为核心的融合型五大万亿量级产业集群进行了论证。
3. 中山市：产业转型升级案例研究
2016年10月，北京大学新结构经济学研究中心与中山市政府签署了战略合作协议，与中山市商务局合作开展历时一年的《中山市产业转型升级案例研究》研究课题。课题组深入调研了中山市重点产业现状和转型升级瓶颈，通过对中山市发展阶段和要素禀赋结构的研判，对中山市当前的发展阶段和核心问题进行诊断，对各类产业转型升级及政府的因势利导提出路径设计和政策策略建议。
4. 雄安新区：雄安新区开放发展先行区建设路径举措研究
受河北省商务厅的委托，新结构经济学研究院课题组对雄安新区开放发展先行区建设路径开展了课题研究。研究依托目前政策中较为明确的雄安新区产业定位，结合河北自贸区建设机遇，通过进一步明确雄安新区定位产业的全球产业发展趋势和分布情况，针对性提出雄安新区开放的重点领域和相关举措。
5. 和田：产业转移扶贫试验区建设和绿洲经济脱贫方略
受和田行署邀请和委托，自2016年以来，林毅夫院长多次率领北京大学、国务院参事室和全国工商联、中国轻工工艺品进出口商会等专家、企业家赴新疆和田开展产业转移调研，重点了解相关产业发展状况，向中央多次递交政策建议，并依托北京大学新结构经济学研究院和田工作站，推动和田产业转移扶贫试验区建设。
6. 广州市：新时代黄埔区广州开发区高质量发展研究
新结构经济学研究院课题组受广州开发区高质量发展研究院委托，立足新结构经济学对高质量发展和新发展理念的认识，探讨在全国发展前列、已经进入高收入发展阶段的黄埔区广州开发区，如何进一步实现产业升级，推动高质量发展。
7. 绍兴市：高质量发展系列研究
在绍兴市政府的参与和支持下，新结构经济学研究院与绍兴文理学院共同成立了新结构经济学长三角（绍兴）研究中心。新结构经济学研究院依托这一中心，主要开展三项研究。一是绍兴市转型升级研究报告，主要面向绍兴市“十四五”期间进一步升级产业、提高收入提出发展方向和相应的政策建议；二是绍兴市融入长三角一体化的战略研究，重点聚焦绍兴市“融杭、联甬、接沪”的区域发展战略，提出如何更好与三市联动发展的策略；三是绍兴与国内外开展产能合作的相关研究，梳理绍兴市可能向国内外转移的部分传统产业生产环节，推动绍兴产业“腾笼换鸟”。
8. 佛山市：建设制造业创新高地的佛山路径研究
2022年受佛山日报社委托承接《建设制造业创新高地的佛山路径研究》课题，该课题根据新结构经济学理论，结合中央部委、广东省相关要求与佛山实际，扭住产业链这个关键，选取家电、陶瓷、机械装备等九大产业，对产业链上下游的大中小不同类型企业进行为期15天的实地调研，与佛山政府部门和相关产业协会沟通洽谈，对全球制造业的发展趋势、佛山制造业历史、现状以及在全国全球竞争中的优势、机遇和挑战进行透彻的分析，总结佛山制造企业穿越疫情与周期影响实现高质量发展的经验，探寻佛山建设制造业创新高地的方向与路径。
9. 克拉玛依：建设新疆副中心城市研究
以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，按照自治区党委赋予克拉玛依高质量发展“第一梯队”的定位，贯彻落实市委、市政府“三个定位”中建设“新疆副中心城市”的新使命、新要求，坚定不移贯彻新发展理念，紧紧围绕高质量发展首要任务，发挥克拉玛依优质科创资源、教育资源、医疗资源带动作用，着力打造区域科技创新中心、人才教育高地、医疗高原，增强城市的辐射能力。积极建设核心区信息中心、区域金融中心、交通枢纽，加强应急保障、物流仓储、文化旅游等服务能力，不断提升城市承载力，增强城市集聚能力。《建设新疆副中心城市研究》主要从新结构经济学视角下结合克拉玛依所处发展阶段的实际情况，构建“一主多元”现代化产业发展体系，提出了一系列的政策建议，具有较强理论指导和实践意义。
